L'hymne national est le "Kimigayo". Les paroles du chant proviennent d'un poème antique apparaissant dans des anthologies telles que Kokin wakashu du 10e siècle et Wakan roeishu du 11e siècle. L'auteur est inconnu. L'interprétation, par le gouvernement japonais, de sa signification avait été présentée par le Premier ministre Obuchi Keizo à une session de la Diète en 1999, comme suit :
"Kimi ¹ dans Kimigayo, sous la Constitution actuelle du Japon, désigne l'Empereur, qui est le symbole de l'Etat et de l'unité du peuple, et qui doit ses fonctions à la volonté du peuple, en qui réside le pouvoir souverain. Kimigayo dans son ensemble décrit l'état d'être de notre pays, qui a l'Empereur -qui doit ses fonctions à la volonté du peuple, en qui réside le pouvoir souverain- en tant que symbole de l'Etat et de l'unité du peuple. Et, il est approprié d'interpréter les paroles de l'hymne comme une prière pour la prospérité et la paix durables de notre pays."
La musique a été composée par Hayashi Hiromori en 1880. En 1893, le Ministère de l'Education en a fait le chant cérémonial devant être chanté les jours fériés dans les écoles primaires. Peu après, il était interprété aux cérémonies d'Etat et lors d'événements sportifs. Identifié populairement comme l'hymne national pendant de nombreuses années, le Kimigayo a été officiellement désigné hymne national en 1999 par la Loi concernant le drapeau et l'hymne national.